在所有侵入性手术中，医疗设备或手术工具与患者无菌组织或粘膜之间的接触都会发生。可能引起感染的有害微生物的引入是这类手术的一个主要问题。如果可重复使用的医疗设备没有彻底消毒或消毒，可能会违反宿主屏障。根据物品的用途不同，关键物品(如接触无菌组织的手术器械)、半关键物品(如接触粘膜的内窥镜)、非关键物品(如只接触完整皮肤的听诊器)分别需要消毒、高级消毒和低级消毒。
清洁必须在高水平消毒和灭菌之前进行。在选择消毒或灭菌程序时，使用者必须权衡各种方法的利弊。遵循这些指南可以加强医疗机构的消毒和绝育方法，降低因受污染的病人护理物品引起的疾病风险。低温消毒系统的进一步发展，缩短了处理时间，提高了仪器再处理能力。随着环境表面污染与卫生保健相关疾病之间的联系越来越清楚，表面消毒的新技术也在发展，包括区域消毒系统和抗菌表面技术。
最近的灭菌技术在医疗机构使用的进展遵循了25年的模式集中在低温灭菌系统。更短的周期，更强的材料兼容性，扩展仪器性能，环境友好，和更低的价格是市场的驱动力。已经上市的低温杀菌系统已经得到了改进，至少还有两种其他技术正在向市场进军。蒸汽灭菌方法现在有新的生物指示剂(BIs)，读取时间更快。
此外，技术也有了巨大的发展，特别是表面消毒。根据《美国感染控制杂志》发表的一篇文章，越来越多的证据表明，卫生保健设施中的环境表面污染与卫生保健相关感染(HAI)直接相关。现有的表面消毒技术已得到加强，以克服各自的局限性，并为房间大小的区域的表面去污/消毒创造可行的替代方案。这些“区域净化系统”旨在加强卫生保健设施的清洁和消毒方法，研究已证明这些方法缺乏效率。在医疗机构常见表面的制造中，具有内在抗菌特性的材料的使用也日益成为防止环境表面污染的一种方式。
加强医疗机构环境表面清洁消毒的必要性已引起广泛关注和重视，成为当前防治污染污染的热点话题。虽然消毒环境表面一直是一项重要的实践，但目前的科学数据表明，这些环境细菌与HAI之间的明确关系，提高了对其重要性的认识。
这种意识，加上HAI的费用，以及报销的潜在损失，促使了地区去污/消毒系统的开发和商业化，以及抗菌表面技术的使用。预计微生物控制住院环境的趋势将持续下去，具有内在抗菌特性的新型环境表面应用材料可能会出现。
